Родина карабаирских лошадей — Узбекистан. Упоминания о превосходных лошадях, разводимых на территории современного Узбекистана, встречаются в трудах историков древности при описании походов Александра Македонского.
Советские ученые-коневоды проследили происхождение карабаира и сделали заключение, что эта лошадь представляет собой сложную популяцию, происшедшую от лошадей южного типа.
Карабаиры хорошо приспособлены к условиям среднеазиатских пустынь и гор, выносливы в работе. Они обладают редкой и ценной особенностью, совмещая в себе упряжные и верховые качества. Запряженный в арбу карабаир может одновременно везти на себе и всадника.
Лошадь сильна, легка на ходу, у нее длинный размашистый шаг. Некоторые карабаиры хорошо бегут рысью. Однако местное население не любит этот аллюр и приучает лошадей к «джюрге» (что-то среднее между шагом и рысью), которым лошадь проходит до 10 километров в час, совершенно не утомляя всадника.
Карабаиры хорошо зарекомендовали себя в национальных конных играх, особенно в игре «кок-пар» (борьба всадников за тушу козла). Племенных лошадей испытывают в скачках.
Основные масти карабаирских лошадей гнедая и серая. Лучшее поголовье сосредоточено на Джизакском конном заводе.